Antik DNA, Atın Hikayesini Ortaya Çıkardı

2024 Yazar: Daisy Haig | [email protected]. Son düzenleme: 2023-12-17 03:15

PARİS - Bilim adamları geçen Çarşamba günü, yaklaşık 700.000 yıl önce yaşamış bir atın DNA'sını çözdüklerini, genç paleo-genomik alanında rekor kıran bir başarı elde ettiklerini söylediler.

Antik buluntu, günümüzdeki tüm atların, eşekler ve zebraların yanı sıra, yaklaşık dört milyon yıl önce, düşünülenden iki kat önce yaşamış ortak bir ataya sahip olduğunu gösteriyor.

Araştırmacılar, atılımın ayrıca DNA örneklemesi için faydasız olduğu düşünülen birçok fosilin aslında genetik hazineyle dolu olabileceğine dair umutları da artırdığını söyledi.

Nature dergisinde yer alan habere göre ekip, hikayenin 10 yıl önce, Kanada'nın Yukon bölgesinde Thistle Creek adlı bir yerde permafrostta fosilleşmiş bir at kemiği parçasının keşfiyle başladığını söyledi.

Danimarka Doğa Tarihi Müzesi'ndeki Jeogenetik Merkezi'nde Fransız araştırmacı olan Ludovic Orlando, "Bu, bacaktan bir metapodial kemik parçası" dedi.

"Yaklaşık 15 santimetre (altı inç) uzunluğunda ve sekiz santimetre (3,2 inç) genişliğinde bir parça."

Kemiğin bulunduğu zeminin radyodasyonu, oradaki organik maddenin -çürümüş yapraklar vb.- yaklaşık 735 bin yıl önce biriktiğini gösteriyor.

Numune, derin soğukta şaşırtıcı bir şekilde korunmuştu - ancak zaman, hücrelerine zarar vermiş ve dolayısıyla yararlı DNA'yı dışarı çıkarma şansını sınırlamış olacaktı.

Orlando AFP'ye verdiği demeçte, "Teknolojimizin sınırlarını zorlamak için eşsiz bir şanstı."

"Dürüst olmak gerekirse, bu fikri ilk ele aldığımızda bunun mümkün olacağını düşünmemiştim."

Araştırmacılar, kan damarları için biyolojik belirteçlerin yanı sıra kemiklerde bulunan ana protein olan kolajen kalıntılarını tespit etmeyi başardıklarında, bu ilk şüpheler laboratuvarda ortadan kalkmaya başladı.

Peki ya hücresel DNA?

O noktada hayal kırıklığı geldi. Üç yıl önce analizin başlangıcında mevcut olan teknoloji, bu küçük DNA parçalarını alıp onları anlaşılır kodlara dönüştürmekten çok uzaktı.

Orlando, "Her 200 denemede yalnızca bir DNA dizisi parçası elde edebildik" dedi.

Bir şeyleri değiştiren şey, sıralama teknolojisindeki nesiller boyu bir değişiklikti.

Tıbbi araştırmalarda bir yenilikten yararlanan bilim adamları, DNA moleküllerini bir sıralama makinesinde "büyütmek" zorunda kalmadan çözmenin bir yolunu buldular.

Bu yaklaşım, değerli numunenin sonsuz arızalarla boşa harcanmaması ve elleçleme ve havaya maruz kalma yoluyla daha fazla bozulma riskinin en aza indirilmesi anlamına geliyordu.

Sonuç, sıcaklık ve ekstraksiyon yöntemi daha fazla ayarlandığında 10 faktöre yükselen başarı oranında üç ila dört kat bir iyileşme oldu.

Orlando, "200'de bir iken yaklaşık 20'de bire çıktık" dedi.

"Bundan ortaya çıkan şey, daha sonra tam bir genetik kodda yeniden birleştirmemiz gereken küçük dizi parçalarıydı" dedi.

"Bin parçaya bölünmüş bir vazoyu onarmak gibi - sadece bunun milyarlarca parçası var!"

Sonuç, 560.000 ila 780.000 yıl önce yaşamış bir hayvandan tam olarak dizilen en eski genomdur.

Önceki rekor, 70.000 ila 80.000 yıl önce yaşamış olan ve Denisova hominin olarak bilinen esrarengiz bir insanın dizilimi ile tutulmuştu.

At dizisi, 43.000 yıl önce Geç Pleistosen'de yaşayan bir atın genomuyla ve beş modern at türünün, bir Przewalski'nin atının (evcil attan ayrılan vahşi bir at türü) genomuyla karşılaştırıldı. ve bir eşek.

Çalışma, "Analizlerimiz, tüm çağdaş atları, zebraları ve eşekleri ortaya çıkaran Equus soyunun günümüzden dört ila 4,5 milyon yıl önce ortaya çıktığını, geleneksel olarak kabul edilen zamanın iki katı olduğunu gösteriyor" diyor.

Ayrıca, Przewalski'nin atını evcil ırklarla çaprazlayarak koruma çabalarının genetik olarak geçerli olduğunu öne sürdü. Vahşi türe çok az genetik müdahale olmuş gibi görünüyor.

Bu ani keşfin ötesinde, bilim adamları, çalışmalarının bir gün, DNA'ları geleneksel olarak dizileme için çok bozulmuş olarak kabul edilen fosiller aracılığıyla tarih öncesi hayvanlara ve hatta kendi atalarımıza ışık tutacağından eminler.

Orlando, "Çok soğuk koşullarda, küçük boyutlu moleküllerin kabaca yüzde 10'u bir milyon yıldan fazla hayatta kalma şansına sahip" dedi.

"Sonsuza dek kapandığını düşündüğümüz bir kapıyı açtık. Her şey teknolojik ilerlemeye bağlı, ancak geleceğin bizi bir çıkmaza değil hazineye götüreceğine inanmak için bir sürü argümanımız var."